6ος αι. (;): Ανέγερση του ναού
766: Μαρτύριο του εικονόφιλου ασκητή Ανδρέα από την Κρήτη και ταφή του στη μονή
2 Δεκεμβρίου 792: Ταφή του αγίου Φιλαρέτου του Ελεήμονος στη γυναικεία μονή «εις την Κρίσιν»
867-886: Ανακαίνιση από το Βασίλειο Α΄ Μακεδόνα
1284: Ανακαίνιση από τη Θεοδώρα, ανιψιά του Μιχαήλ Η΄ Παλαιολόγου
1453-1489: Λειτουργεί ως γυναικείο μοναστήρι
1489: Μετατροπή σε τζαμί από το βεζίρη Κότζα Μουσταφά
1765: Καταστροφές από σεισμό
1937: Νεότερες προσθήκες